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AMPK es un complejo heterotrimérico compuesto por una subunidad catalítica α y subunidades regulatorias β y γ, cada una de las cuales está codificada por dos o tres genes distintos (α1, 2; β1, 2; γ1, 2, 3). La quinasa se activa por un aumento en la relación AMP/ATP debido al estrés celular y ambiental, como el choque térmico, la hipoxia y la isquemia. El supresor tumoral LKB1 fosforila a AMPKα en Thr172 dentro del bucle de activación, y esta fosforilación es necesaria para la activación de AMPK. Las evidencias acumuladas indican que AMPK no solo regula el metabolismo de los ácidos grasos y el glucógeno, sino que también modula la síntesis de proteínas y el crecimiento celular a través de las vías EF2 y TSC2/mTOR, así como el flujo sanguíneo mediante eNOS/nNOS.

Los proteínas del grupo poliglobina (PcG) contribuyen al mantenimiento de la identidad celular, a la autorrenovación de células madre y a la regulación del ciclo celular, así como a la oncogénesis, mediante el mantenimiento del estado silenciado de los genes que promueven la especificación de linajes celulares, la muerte celular y la detención del ciclo celular. Los proteínas PcG existen en dos complejos que cooperan para mantener el silenciamiento génico a largo plazo mediante modificaciones epigenéticas del cromatina. El primer complejo, Eed-Ezh2, es reclutado a los genes por factores de transcripción unidos al ADN y metila la histona H3 en Lisina 27. Esta actividad de histona metiltransferasa requiere las subunidades Ezh2, Eed y Suz12 del complejo. La metilación de Lisina 27 facilita el reclutamiento del segundo complejo, PRC1, que ubiquitina la histona H2A en Lisina 119. El PRC1 está compuesto por Bmi1 y RING1A (también RING1 o RNF1), los cuales actúan para potenciar la actividad de ligasa E3 de ubiquitina de una subunidad catalítica adicional, RING1B (también RING2 o RNF2). Los proteínas PcG juegan un papel importante en la regulación de la proliferación celular y el envejecimiento mediante la represión de los genes p16 INK4A y p19 ARF, y son necesarios para el mantenimiento de las células madre hematopoyéticas y neurales adultas, así como de las células madre embrionarias.

La fosfolipasa C específica de fosfoinositídeos (PLC) desempeña un papel fundamental en la señalización transmembrana. En respuesta a estímulos extracelulares, como hormonas, factores de crecimiento y neurotransmisores, el PLC hidroliza el fosfatidilinositol 4,5-bisfosfato (PIP2) para generar dos mensajeros secundarios: inositol 1,4,5-trifosfato (IP3) y diacilgliceroles (DAG). Se han identificado al menos cuatro familias de PLCs: PLCβ, PLCγ, PLCδ y PLCε. La fosforilación es uno de los mecanismos clave que regulan la actividad del PLC. El PLCγ se activa tanto por quinasas tirosina receptoras como no receptoras. El PLCγ forma un complejo con receptores de EGF y PDGF, lo cual conduce a la fosforilación del PLCγ en Tyr771, 783 y 1248. La fosforilación por Syk en Tyr783 activa la actividad enzimática del PLCγ1. El PLCγ2 está implicado en la señalización dependiente de antígeno en células B y en la señalización dependiente de colágeno en plaquetas. La fosforilación por Btk o Lck en Tyr753, 759, 1197 y 1217 se correlaciona con la actividad del PLCγ2.

La Na,K-ATPasa es un dímero integral de membrana que pertenece a la familia de las ATPasas del tipo P. La fosforilación de la Na,K-ATPasa en el residuo Tyr10 se ha relacionado con la regulación de la actividad enzimática en respuesta a hormonas y neurotransmisores. Las cadherinas son una superfamilia de glicoproteínas transmembrana que contienen repeticiones de cadherina de aproximadamente 100 residuos en su dominio extracelular. Las cadherinas median la adhesión célula-célula dependiente de calcio y desempeñan roles críticos en el desarrollo normal de los tejidos. La subfamilia clásica de cadherinas incluye N-, P-, R-, B- y E-cadherina, así como unos diez miembros adicionales que se encuentran en las uniones adherentes, una estructura celular cerca de la superficie apical de las células epiteliales polarizadas. El 4F2hc es una proteína transmembrana que pertenece a la familia de portadores de solutos. El 4F2hc forma complejos heterodiméricos con varios transportadores de aminoácidos, como LAT1 y LAT2, y regula la captación de aminoácidos. Las proteínas integrales de 21-24 kDa, las caveolinas, son los componentes estructurales principales del microdominio de la membrana plasmática enriquecido con colesterol/fosfolípidos llamado caveola. Se han identificado tres miembros de la familia de caveolina (caveolina-1, -2 y -3) con diferentes distribuciones tisulares. La ectonucleotidasa pirofosfatasa-fosfodiesterasa 1 (ENPP1) es una proteína transmembrana de paso simple principalmente implicada en la hidrólisis de ATP en la membrana plasmática. El ENPP1 desempeña roles importantes en la mineralización ósea y la calcificación de tejidos blandos.

Este artículo detalla el mecanismo de activación, la modificación por fosforilación de proteínas clave y la regulación transcripcional de la vía de señalización NF-κB. En el citoplasma, NF-κB permanece inactivo al unirse a las proteínas inhibidoras IκB. El complejo IKK fosforila IκBα, IκBβ e IκBε, desencadenando su ubiquitinación y degradación proteosómica. Los dímeros de NF-κB liberados luego se translocan al núcleo para ejecutar funciones transcripcionales. La familia de NF-κB en mamíferos está compuesta por cinco miembros: p65/RelA, c-Rel, RelB, NF-κB1 y NF-κB2. Tras el procesamiento proteolítico, las proteínas precursoras forman dímeros con proteínas Rel para unirse al ADN. Múltiples sitios de fosforilación modulan la actividad transcripcional de p65. Este documento también lista anticuerpos comerciales para investigaciones sobre esta vía, junto con su reactividad en especies y técnicas experimentales aplicables, así como referencias relevantes, proporcionando una guía para investigación básica y detección experimental de la vía NF-κB.

La familia de factores nucleares κB (NF-κB) participa extensamente en las respuestas inflamatorias e inmunológicas. Distintamente del pathway canónico de NF-κB activado por TNFα y LPS, el pathway no canónico es desencadenado por BAFF, CD40L y otros estimulos. Este pathway se basa en la quinasa inducida por NF-κB (NIK) e IKKα para mediar la fosforilación y la degradación proteasomal parcial de p100 de NF-κB2 en p52 activo. TRAF2 y TRAF3 actúan como reguladores negativos en este proceso. El pathway no canónico de NF-κB es esencial para la maduración de células B, la formación de tejidos linfoides periféricos y la prevención de enfermedades autoinmunes. Este artículo también lista una serie de anticuerpos específicos para detección de proteínas relacionadas, junto con referencias de investigación relevantes.

1. Las proteínas adaptadoras multifuncionales denominadas TRAF (factores asociados a receptores de TNF) se unen a receptores superficiales y reclutan proteínas adicionales para formar complejos de señalización multiproteica capaces de promover respuestas celulares.
2. Los miembros de la familia TRAF comparten un dominio carboxiterminal común llamado "dominio TRAF", el cual media las interacciones con las proteínas asociadas; muchos también contienen motivos de dedo zinc/amino terminal.
3. Los primeros TRAF identificados, TRAF1 y TRAF2, fueron descubiertos gracias a sus interacciones con el dominio citoplasmático del receptor 2 de TNF (TNFRII).
4. Los seis TRAF conocidos (TRAF1-6) actúan como proteínas adaptadoras para una amplia gama de receptores de superficie celular y participan en la regulación de la supervivencia, proliferación, diferenciación y respuestas al estrés.

La heterogeneidad de las CAF no está impulsada por variaciones genéticas, como mutaciones génicas o anomalías cromosómicas, sino que depende de la reprogramación transcripcional y el remodelado epigenético, regulados dinámicamente por múltiples factores que incluyen el estado de mutación de las células tumorales, las señales del microambiente, la localización espacial y el estado del huésped. Su plasticidad se manifiesta como diferentes subpoblaciones de CAF que experimentan interconversión fenotípica y funcional con el progreso tumoral y los cambios ambientales, participando ampliamente en todo el proceso de evasión inmune tumoral, remodelado estromal, angiogénesis, infiltración neural y resistencia al tratamiento. Por tanto, analizar sistemáticamente las características estratificadas de la heterogeneidad de CAF, los mecanismos reguladores de la plasticidad y aclarar su papel en la terapia tumoral tiene un valor académico significativo e importancia clínica para el desarrollo de estrategias anti-tumor dirigidas estromales precisas y para superar los cuellos de botella del tratamiento de tumores sólidos.

El traumatismo craneoencefálico (TCE) es un problema de salud mundial que afecta significativamente al paciente así como a su familia. El costo anual total del TCE no fatal en 2016 fue de 40,6 mil millones de dólares en los Estados Unidos. Además de la lesión cerebral aguda, incluso los casos leves pueden llevar a deterioro cognitivo y cambios psiquiátricos a largo plazo. A más largo plazo, los pacientes con TCE muestran menor resiliencia frente a patologías asociadas a enfermedades neurodegenerativas. El tratamiento del TCE se hace más difícil debido a la falta de biomarcadores fiables para detectar el TCE. Varios proteínas son objeto de interés, las cuales son candidatas para medición en sangre tras el TCE. La proteína fibrilar ácida glial (GFAP) es una proteína de filamento intermedio astrocítico. Como proteína del citoesqueleto, la GFAP ayuda a proporcionar soporte estructural a los astrocitos, que brindan soporte metabólico a las neuronas y mantienen la barrera hematoencefálica. El número y tamaño de los astrocitos, en un proceso llamado astrogliosis, también se correlaciona positivamente con la lesión cerebral. Además expresado abundantemente en astrocitos, el S100B se utiliza comúnmente como marcador astrocítico y se correlaciona positivamente con el TCE. El neurofilamento-L (NfL) y tau son parte del citoesqueleto neuronal que proporcionan estructura a los axones. Los axones están cubiertos por una membrana multicapa llamada vaina de mielina. La proteína básica de la mielina (MBP) se encuentra enriquecida en la mielina y ayuda a mantener su estructura. El UCHL1 y el Enolasa-2 son hidrolasas de ubiquitina y enzimas glucolíticas, respectivamente, que se encuentran enriquecidas en neuronas. El PSD95 es una proteína adaptadora enriquecida en sitios postsinápticos en las neuronas. Tras la lesión cerebral, las proteínas enriquecidas en neuronas, así como las proteínas que mantienen la integridad neuronal/axonal, pueden medirse en sangre, reflejando el daño neuronal.

El ciclo del ácido tricarboxílico (CTA) incluye diversas reacciones enzimáticas que constituyen una parte clave de la respiración aeróbica celular. El transporte del producto final glucolítico piruvato hacia las mitocondrias y la descarboxilación del piruvato dentro del CTA generan energía mediante fosforilación oxidativa bajo condiciones aeróbicas. Dos proteínas de la membrana interna mitocondrial, el portador 1 de piruvato mitocondrial (MPC1) y el portador 2 de piruvato mitocondrial (MPC2), forman un complejo de 150 kDa y son proteínas esenciales en el transporte facilitado de piruvato hacia las mitocondrias. La citrato sintasa cataliza la reacción primera y limitante por velocidad del CTA. La aconitasa 2 mitocondrial (ACO2) cataliza la conversión del citrato a isocitrato mediante cis-aconitato. IDH1 e IDH2 son dos de las tres deshidrogenasas de isocitrato que catalizan la descarboxilación oxidativa de isocitrato a α-cetoglutarato (α-KG). IDH1 funciona como supresor de tumores en el citoplasma y los peroxisomas, mientras que IDH2 se encuentra en las mitocondrias e interviene en el CTA. Se han identificado mutaciones en IDH2 también en gliomas malignos. La dihidrolipoamida succiniltransferasa (DLST) es un subunidades del complejo de deshidrogenasa de α-cetoglutarato, un complejo enzimático clave en el CTA. El subunidad A de la deshidrogenasa de succinato (SDHA) es un componente del CTA y de la cadena de transporte de electrones e interviene en la oxidación de succinato. La fumarasa cataliza la conversión de fumarato a malato. La deficiencia de fumarasa lleva al acumulación de fumarato, un oncometabolito que ha demostrado promover la transición epitelial-a-mesenquimal (EMT), un proceso de desarrollo que ha sido implicado en oncogénesis.